生信爆款入门-第12期(今年最后一期)

生信技能树的粉丝都知道我们有一个全国巡讲的良心学习班,口碑爆棚,生物信息学入门省心省时省力!先看看大家的反馈吧:

  • 数据挖掘第一期学习反馈
  • 数据挖掘课程能带给你什么收获
  • 站在巨人的肩膀上看风景
  • 欢迎加入生信技能树小圈子
  • “生信入门过半“感想
  • 为什么选择生信技能树生信入门全球听(一个月马拉松式授课)
  • 花了那么多时间兜兜转转,我终于找对了门
  • 我一路风尘仆仆赶来,还好没和你擦肩

2020疫情严重,在保质保量的高标准严要求下,我们教学团队仍然艰苦奋斗把这些好内容全面线上化不要犹豫了,滑到文末,找到生信技能树官方报名小助手微信,直接扫描二维码进行咨询并且报名参加,2021年的1月4号开课,长达3周直播辅导互动答疑你值得拥有,这绝对会是你人生最正确的决定之一。明年应该是3月份之后根据疫情被控制的情况选择性开启线下全国巡讲哦,敬请期待。

我们的生信爆款入门学习班每到一个城市,当地的小伙伴们口碑传播的比我们生信技能树自媒体矩阵还积极!已经打磨成为了标准品,市面上最快速的帮大家系统性入门生物信息学的绝佳课程,下面是2019的宣传推文列表

  • 生信技能树(爆款入门培训课)全国巡讲约你

  • 生信技能树(爆款入门培训课)巡讲第一站-重庆 (已结束)

  • 生物信息学全国巡讲之粤港澳大湾区专场 (已结束)

  • 生信技能树(爆款入门培训课)巡讲第二站-济南 (已结束)

  • 生信技能树(爆款入门培训课)巡讲-千呼万唤进北京(已结束)

  • 生信技能树(爆款入门培训课)巡讲- 广州和上海(已结束)

  • 中间省略12个城市!

  • 生信入门课全国巡讲2019收官--长沙站 (已结束)

而且我们一直在收集学员们的反馈,逐步改进课程内容设置,研发好授课技巧,注重学员回访,一起进步!

本来呢,2020我们会在2019的基础上面增加:南昌,太原,海口,厦门,青岛,沈阳等城市哦,希望大家在学校门口等我们即可!但是,计划赶不上变化,一场席卷大江南北的新冠病毒疫情让我们防不胜防,为最大程度保护我们的巡讲授课团队和粉丝们,至少得取消10个以上的城市上门授课服务。

如果你计划在你的城市提供场地,欢迎联系生信技能树创始人jimmy,协商时间地点,见:一年一度的生信爆款入门全球听限量免费活动又来啦!

以前是课程虽好,但名额稀少

参加过其他培训的朋友都知道,市面上的培训班两天的收费就要三千以上,学费、路费和住宿费加起来,正常花费在6000元上下。很多培训班的举办方的还不是专业做培训,而是作为公司宣传的一个渠道。参加过的都懂,没有人为你的学习负责,大家只是做好分内之事依靠那个商业模式赚钱罢了,动辄招生一百来号人,酒店会议室现场乌压压的一片,授课效果可想而知。

而我们全国巡讲的良心学习班,由于时间限制,不可能达到全国300个城市一一覆盖,只能说挑选粉丝聚集地城市,大家就近入学,理论上一个城市我们一年只去一次(特大城市除外),错过等明年(还不一定能等到)。

依据2019的全国巡讲经验来看,即使我们成功到达了大家的城市,也会部分朋友出现时间冲突,比如恰好那几天考证或者值班等等,所以看到一些广州中山大学的朋友跑去长沙,一些上海的朋友跑去南京或者杭州。而且小城市我们其实是限制培训班学员数量的,通常是20人,这样又导致一大波人无法报名,搞得好像我们在弄饥饿营销策略。

再加上我们还有17%的海外用户,2019的全国巡讲我只看到暑假的时候有3个趁假期飞回国赶上我们学习班的,大量海外朋友都因为各种条件限制被忽略了,我们也时候做些什么来帮助他们了。

综上所述,我们生信技能树教学团队推出2020全国巡讲全球听的全新教学项目,希望尽最大可能帮助大家利用好自己的数据项目,为你的科研事业增光添彩!报名之后,可以自由选择任意形式学习方式,可以只参加网课直播,也可以选择一次线下课,或者两个都选!

授课形式

全国巡讲线下课程持续3天,每天朝九晚六,授课8个小时,所以给大家发的结业证书是24个小时的学习量。待疫情结束,我们仍然是会进行线下全国巡讲,保证每个月至少2次,不同的城市。大家只需要一次报名,即可选择任意城市参加一次线下课程,还能同时参加视频直播课程,提前学!(线上线下相结合!

全网视频直播课程

全国巡讲线下课程大家看我们的往期介绍即可,授课知识点目录在 生信入门课全国巡讲2019收官--长沙站 。而全网视频直播课程,我们尽量模拟线下课程的体验,开课前期有专门的助教一对一解决数据处理电脑环境的准备工作问题,报名费与线下培训费用一致(3199元),提供发票、会议通知等文件方便报销。

如果你已经看完了我们生信技能树B站100个小时视频,而且能看懂,请不要报名,即使你再怎么想感谢我,一定要来支持我,也无需报名!我们不是乞丐,你帮忙推荐给真正有需要的师弟师妹即可。

课程中间授课知识点和互随堂作业习题交织,着重强调互动体验!

24小时线下集训学习量变成60个小时的线上全网直播视频课程,连续4个星期,每个星期5天,每天的晚上8~11点的3个小时互动授课(周三、周日休息)

内容安排如下:

  • 第一周R语言

    • R语言数据类型与数据结构

    • 函数与R包

    • 文件读写

    • R语言作图

    • 拓展补充部分

  • 第二周GEO数据挖掘

    • GEO数据库介绍

    • 数据下载和质控

    • 样本分类与芯片注释获取

    • 差异分析和富集分析

    • 多分组数据处理和多数据集处理

    • 蛋白互作网络绘制

  • 第三周Linux

    • 服务器登录和Linux操作系统认知,基本文本文件及目录操作

    • 文本处理三驾马车(awk,sed,grep)实战演练,基于gencode数据库human的gtf文件

    • conda管理生物信息学软件,环境变量

    • 相对路径和绝对路径,通配符及参数扩展,快捷方式

    • 批处理和脚本编程

  • 第四周RNA-seq实战

    • 生物信息学常见数据格式,fastq,fasta,sam,bam,vcf,gtf

    • 转录组背景知识

    • 转录组上游流程,文献测序数据下载到质控,比对,定量,拿到表达矩阵

    • 转录组下游分析,3大R包走转录组表达矩阵的差异分析,富集分析,GSEA

    • 其它NGS组学介绍

直播期间将穿插练习,讲练结合,充分互动,强调在实战中进步。讲师分章节在线授课及答疑,突发情况可在线求助我们的助教团队,课堂进度也会根据学员们的理解程度灵活作调整。

课程会录屏并且编辑好发给大家,哪怕中间缺一次课,也可以其它时间尤其是周六日补起来。但是缺太多可能有问题,所以大家需要迁就一下我们的时间安排:连续4个星期,每个星期5天,每天的北京时间晚上8~11点

即使你赶不上直播课程,或者始终觉得线上学习效果不好,仍然是可以选择继续就近参加一次我们不同城市的线下学习班的。(注:线下蹭课需额外缴纳500元的场地公摊费)

第一个福利:买一得五

报名2020全国巡讲全球听的全新教学项目者,除了可以参加60个小时的线上视频直播课程,以及一次任意城市的线下学习班之外,还可以继续享受5个福利:

价值3199的Linux系统入门视频及配套习题免费领取

  • Linux云服务认识及登录

  • 操作系统目录和文件操作

  • 文本处理基础及进阶三驾马车

  • 元字符,通配符及shell中的各种扩展

  • 软硬链接,绝对路径和相对路径,环境变量

  • 任务提交及批处理

  • 软件安装及管理

  • 其它视频课程及PDF书籍全套

价值3199的R语言系统入门视频及配套习题免费领取

  • 了解常量和变量概念

  • 加减乘除等运算(计算器)

  • 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子)

  • 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表)

  • 文件读取和写出

  • 简单统计可视化

  • 无限量函数学习

  • 其它视频课程及PDF书籍全套

价值3199的RNA-seq数据分析视频及配套习题免费领取

RNA-seq我们在生信技能树应该是至少推出了400篇教程,而且是我们全国巡讲的标准品知识点,其中还有一个阅读量过两万的综述翻译及其细节知识点的补充:

  • RNA-seq的counts值,RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同

  • RNAseq数据,下载GEO中的FPKM文件后该怎么下游分析

但凡有Linux基础以及R语言认知,听完了我B站的RNA-seq分析流程都是可以迅速上手自己的项目啦!

而且我们还继续赠送单细胞转录组数据分析课程

价值3199的GEO和TCGA数据挖掘视频及配套习题免费领取

GEO数据挖掘视频我们已经打磨好了多套无脑代码,在:一个甲基化芯片信号值矩阵差异分析的标准代码 ,和免费的数据分析付费的成品代码 。当然了,需要你具备R语言基础知识,才有可能看得懂和使用我们的完美代码!再比如3年前的收费视频课程:3年前的GEO数据挖掘课程你可以听3小时或者3天甚至3个月,也是直接免费在B站:

  • 这个课程超级棒,B站免费学习咯:https://m.bilibili.com/video/BV1dy4y1C7jz
  • 配套代码在GitHub哈:https://github.com/jmzeng1314/GSE76275-TNBC
  • TCGA数据库挖掘,代码在:https://github.com/jmzeng1314/TCGA_BRCA
  • GTEx数据库挖掘,代码在:https://github.com/jmzeng1314/gtex_BRCA
  • METABRIC数据库挖掘,代码在:https://github.com/jmzeng1314/METABRIC

然后马上就有了一千多学习量,而且有学员给出来了图文并茂版本万字笔记,让我非常感动!扫描下面二维码马上就可以学习起来啦,笔记需要至少半个小时来阅读哦!

生信爆款入门-第12期(今年最后一期)

当然,前提是你至少生信入门了!不然,海量的学习资源对你来说仅仅是空中楼阁。

关于TCGA数据挖掘,大多数需求其实也就是差异和相关性,生存分析等等,我们的视频目录如下:

  • P1-TCGA-101-课程介绍-需要哪些背景知识

  • P2-TCGA-102-课程导读-如何使用我的github代码

  • P3-TCGA-103--TCGA数据库大有作用-不仅仅是灌水

  • P4-TCGA-201-背景介绍及网页工具大全

  • P5-TCGA-202-其它数据库介绍

  • P6-TCGA-203-使用Xena网页工具

  • P7-TCGA-204-使用firehose网页工具

  • P8-TCGA-205-文章规律讲解

  • P9-TCGA-301-数据下载方式导言

  • P10-TCGA-302-GDC下载数据实战

  • P11-TCGA-303-GDC数据整理

  • P12-TCGA-304-GDC下载数据续集

  • P13-TCGA-305-R-TCGA包下载数据及数据提取

  • P14-TCGA-306-使用GDC和firehose下载-TCGA的胃癌的甲基化信息数据

  • P15-TCGA-307-使用GDC和Xena下载RNA-Seq的表达矩阵并且比较

还有很多学员笔记:4个小时TCGA肿瘤数据库知识图谱视频教程又有学习笔记啦

价值3199的表观调控等多组学分析视频及配套习题免费领取

  • 01 果蝇参考基因组和注释文件准备

  • 02 文献测序原始数据下载

  • 03 ChIP-seq 数据质量控制与过滤

  • 04 ChIP-seq 数据从比对到 Peaks calling

  • 05 RNA-seq 数据从比对到定量

  • 06 用幕布展示此课程目录

  • 07 验证目标基因的指定外显子 knock out 是否有效

  • 08 多个样本基因信号矩阵来相关性计算与可视化

  • 09 对RNA-seq数据找差异基因以及可视化

  • 10 根据差异倍数来计算样本间相关性

  • 11 使用 ChIPseeker 对单组 Peak 进行注释与可视化

  • 12 对多组 Peaks 进行批量注释与可视化

  • 13 通过 bw 文件来计算 ChIP-seq 样本间相关性

  • 14 探索ChIPQC 包用法并且查看 ChIP-seq 数据质量

  • 15 最新版参考基因组注释peaks之果蝇 dm6

  • 16 样本间 Peaks 交集韦恩图

  • 17 基因组版本注释转换

  • 18 使用 R 和 linux 对多个 bed 进行骚操作处理

  • 19 对单个 bed 文件和 bw 文件可视化

  • 20 多个 bw 文件进行可视化

  • 21 获得差异表达基因 bed 文件

  • 22 对多个基因集进行富集分析

如果你是生信技能树真爱粉,其实你这时候应该明白了, 上述视频课程虽然写着价值3199,但实际上我从来没有收过大家一分钱,早就免费发布在B站了。

如果你确实是第一次接触我们生信技能树,那么首先恭喜你,你找到家了,先看看我们以前的成果:

  • 生信技能树的2019年终总结

  • 2020学习主旋律,B站74小时免费教学视频为你领路

根据我与几千名粉丝的沟通得出了一个结论,资料其实并不缺,大家缺的是第一步,是互动是耐心帮你解决最开始的拦路虎这样的服务,所以我们才有线下全国巡讲,亲自上门帮你解决电脑面前的报错,让你的入门不再忐忑。预祝2020年的你,在我们友好的教学团队带领下入门后,生信技能树历史教程合辑会成为你真正的宝藏!

还有惊喜福利

我们每个讲师都会给大家准备几个独家技能小福利

  • 搜索技巧、学习方法、效率工具;

  • 文献查找、翻译、下载、管理工具;

  • PPT技巧、云同步工具、资料推荐。

是否包教包会?

我们不希望看到死缠烂打,胡搅蛮缠的学生,那些自己从来不主动学习,不按照教学计划看视频加完成作业的请不要报名,免得到时候大家都闹心!

然后,大家其实看得出来,我们的教学更加注重基础知识,因为我们都是跨专业一点一滴学过来的,大家入门的痛苦我们都懂,很多朋友没有任何R基础就跑去学单细胞数据处理,只能是走一步摔一跤,还不如爽快一点,在你的2020,抽出时间,跟着我们生信技能树教学团队一起攻克Linux和R,后续数据分析的提高,我们在生信技能树/生信菜鸟团还有1.3万篇教程,其中至少有1427篇数据分析实战教程可以说是涵盖了一个全栈生信工程师技能的方方面面!

2020全国巡讲全球听的全新教学项目不包含哪些?

我们不免费提供私人项目咨询服务,仅仅是基础技能教学,我们的理念是让更多人有能力玩转自己的数据,而不是我们替你做分析,我们的目标是培养10万生信工程师!

我们也不提供个性化分析答疑,比如你的WGCNA项目为什么那么奇怪,需要 调整那些参数?你的多个数据集矫正批次效应为什么用了我们生信技能树教程代码仍然不理想?你的GSEA分析为什么不显著,还可以测试哪些统计学方法这样的。但是如果你的疑惑具有普遍性,我们会尽快写成教程在微信公众号推文发出去,比如 对转录组测序的counts矩阵去除批次效应 。

我们就是干干净净的教学,帮助你克服困难安装及打开rstudio,在里面敲代码自由自在的玩转各种统计可视化函数。帮你认识Linux服务器,了解NGS数据的上游分析是什么,完完整整的跑一个RNA-seq数据分析流程。

是否有优惠

没有优惠的。如果是录制好的视频,我可以免费送给所有人看,这个没有问题,因为边际成本为0,但是如果要答疑,一般来说肯定就得收费了。我们的全球直播课程,人力资源消耗更是明显,讲师团队,助教团队,准备工作,答疑,发票,财务等等,都不是靠爱发电的。如果你确实没有经费,尽量自己听我们的免费视频,免费代码,多看教程,只是会多走一些弯路,慢一点学会而已,比我们四五年前自己瞎摸索好多了,毕竟你们有生信技能树作为你的靠山。但是作为公司,我们只能提供服务给能负担得起的客户,希望你理解!

如果你觉得我们免费提供了那么多资料你都不好意思不付费,但是确实捉襟见肘呢,也可以把这个课程推荐给你身边的博士后以及年轻生物学PI,我始终觉得,他们每个人都需要参加这个全国巡讲入门课程。因为术业有专攻,他们生物学背景知识非常好,科研思维能力很强,但就是数据认识不足,这个短板,值得花时间在我们这里解决掉。

如何报名

同样的,我全权委托给教学小助手负责报名相关事宜,如果仅仅是参加网课,那么缴费3199即可。

如果同时要参加疫情过后的线下面对面学习班,可以预缴500元场地费或者到时候真的想参加了再缴费,我们会提前一个月发布线下面对面开课通知(取决于疫情进展情况)哈。

第12次直播(2021-1-04)就开始哦,早报名早学习,持续4周我们专业的授课团队等你学习!

(PS: 如果联系小助手回复不积极,也不要急躁哦,课程咨询人数太多,不定期处理的压力也不小,你可以在此推文留言我们先简单交流一下哈!)

报名请添加技能树小助手微信咨询!

生信爆款入门-第12期(今年最后一期)
生物医学科研方法

数据挖掘(GEO,TCGA,单细胞)第10期(今年最后一期)

2020-12-31 5:25:11

生物医学科研方法

比较不同流程(limma/voom,edgeR,DESeq2 )差异分析的区别

2020-12-31 5:25:28