单基因免疫浸润纯生信,发4.48分2区SCI

单基因免疫浸润纯生信,发4.48分2区SCI今天给大家介绍一篇单基因免疫浸润相关纯生信的SCI文章,文章发表于JOURNAL OF CELLULAR AND MOLECULAR MEDICINE,最新影响因子4.486分。

单基因免疫浸润纯生信,发4.48分2区SCI

一 研究类型

单基因纯生信分析

二 研究方法

Oncomine;TIMER2;PrognoScan;Kaplan-Meier plotter;GEPIA

三 结果解读

1 TGFβ2  基因表达分析

作者首先用oncomine数据库和TIMER2数据库分析TGFβ2在不同肿瘤中的表达。结果是TGFβ2 在多数肿瘤中均是高表达的

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2 TGFβ2 预后分析

作者使用PrognoScan数据库对TGFB2在不同肿瘤不同数据集进行预后分析,发现TGFB2与breast,lung, blood, ovarian, prostate, brain and colon cancer这些肿瘤预后相关 (Figure 2A–H) 。作者又使用了Kaplan-Meier plotter 数据库进行预后分析,发现TGFB2的高表达在一些肿瘤中预示着差的生存,包括胃癌和卵巢癌(Figure 2I–L). 在另外一些肿瘤TGFB2的低表达预示着差的生存,比如肺癌(Figure 2M–N)。而在乳腺癌中是没有差异的(Figure 2O–P)。

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3 TGFβ2 与胃癌临床特征相关性

接下来,作者利用Kaplan-Meier plotter数据库评估TGFβ2表达与胃癌患者临床病理结果之间的关系,探讨其潜在机制。作者发现TGFβ2的表达与OS、DFS及患者性别、分期、T分期、N分期、M分期、Lauren分型及分化程度均显著相关(表1)。作者进一步发现TGFβ2的表达与胃癌患者的淋巴结转移程度相关。

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4 TGFβ2 与胃癌免疫细胞浸润相关性分析

接下来,作者使用TIMER数据库探讨了TGFβ2表达与39种肿瘤类型的免疫细胞浸润程度之间的关系。结果提示TGFβ2在胃癌免疫细胞浸润中起着重要的调节作用,对巨噬细胞浸润的影响尤为明显。

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5 TGFβ2 与免疫细胞marker相关性分析

接下来,作者利用TIMER和GEPIA数据库进一步探讨了在STAD中TGFβ2表达与免疫细胞浸润水平之间的关系,这表明在胃癌(STAD)中,TGFβ2可能能够调节巨噬细胞的极化。TGFβ2表达升高也与STAD中DC细胞浸润增加有关,DC标志物BDCA-1、BDCA-4和CD11c与TGFβ2表达相关。提示TGFβ2与肿瘤DC的渗透密切相关。

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到此,本文的内容就结束了。本文是2019年11月投稿,2020年接收的。如果现在的话,做这些结果肯定是不够发表4分多的SCI。当然了,命好的人除外。下回见。

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