miRNA‑mRNA调控网络发文思路

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之前分享的高分文章被吐槽说:难度太大了,成本太高了,时间周期太久了。这些分享一篇简单、快捷、容易实现的参考范文(基本上人人都会操作):作者通过下载GEO数据库的miRNA和mRNA数据构建miRNA‑mRNA调控网络进行发文。这篇范文发表在PLoS one上,也就是科研人常常提到的“江湖四大神刊”之一,影响因子:2.74,中科院最新分区:2区参考文章来源:PMID: 33434215 DOI:10.1371/journal.pone.0244394。

参考文章题目:Identification of biomarkers and construction of a microRNA‑mRNA regulatory network for clear cell renal cell carcinoma using integrated bioinformatics analysis


分析思路:

1、在GEO数据库上搜索相关的miRNA和mRNA数据,然后下载整理进行差异分析

2、对差异的miRNA进行GO、KEGG富集分析

3、对差异基因进行PPI分析并筛选出重要的子网络,同时也对差异基因进行GO、KEGG富集分析

4、构建miRNA-mRNA网络

5、对网络中的差异基因进行生存分析

总结:

这篇文章发文思路比较简单,文章图片清晰整洁,作者仅仅分析了GEO数据库中的数据,并没有进行下一步的验证。其实,在这篇文章的基础还可以通过下载TCGA数据库的数据进行相关的验证,并且可以将网络中重要的miRNA或者基因构建模型计算risk score,然后将risk score结合临床因素进行分析


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