厦门大学附属中山医院张孝斌团队:暴露于间歇缺氧移植瘤小鼠肿瘤微小RNA差异性表达——基于二代基因测序分析 | AME作者面对面

厦门大学附属中山医院张孝斌团队:暴露于间歇缺氧移植瘤小鼠肿瘤微小RNA差异性表达——基于二代基因测序分析 | AME作者面对面-医学科研网
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分享团队:
厦门大学附属中山医院张孝斌团队
所刊杂志:
Translational Cancer Research点击查看杂志详情与影响因子
文章标题:
暴露于间歇缺氧移植瘤小鼠肿瘤微小RNA差异性表达:基于二代基因测序分析(Differential expression of microRNAs in xenografted Lewis lung carcinomas subjected to intermittent hypoxia: A next-generation sequence analysis)

内容亮点

阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)与肿瘤的发生和死亡密切相关,但二者之间的潜在联系机制尚不清楚。已有研究发现微小RNA(miRNAs)与肿瘤的发生和进展密切相关。在OSA人群中miRNAs是否有差异表达尚不明确。本研究通过试验研究了解OSA的重要病理生理学特征-间歇缺氧(IH)-是否可影响移植瘤小鼠肿瘤中众多miRNAs变化。通过二代基因测序(NGS)的方法检测暴露于正常氧或IH状态下小鼠肿瘤组织中miRNAs变化。并应用定量聚合酶链反应(RT-PCR)对前10位通过NGS筛查出具有明显差异表达的miRNAs进行验证。

进一步应用GO软件和KEGG信号通路分析受差异表达miRNAs调控的潜在靶基因。研究结果发现在正常氧和IH组比较时共发现485个差异表达的miRNAs(259新型miRNAs和226个已知miRNAs)。在IH组154个miRNAs表达上调,331个miRNAs表达下调。而进一步的RT-PCR结果验证了前5个已知miRNAs (miR-767, miR-466f-5p, miR-5122, miR-124-3p 和 miR-590-3p)和5个新型miRNAs (miR-140, miR-130, miR-301, miR-177 和 miR-90)的组间差异表达。此外,GO和KEGG通路分析显示受差异表达miRNAs调控的靶基因富集于以下过程和通路中:生物反应、细胞代谢和生物合成过程以及分子功能。

本研究通过NGS发现IH可引起众多miRNAs差异表达。这些受IH诱导发生差异表达的miRNAs很可能参与了OSA促进肿瘤发生和进展的分子生物学过程。(论著中文信息由第一作者整理提供,欲览英文原文请扫描下方二维码)

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第一/通讯作者:张孝斌

张孝斌,男,医学博士,厦门大学附属中山医院呼吸与危重症医学科副主任医师。福建省医学会呼吸病学分会青年委员,厦门医学会呼吸病学分会委员,福建省医院学会呼吸研究分会常务委员,福建省中医药学会委员。以第一作者发表SCI论文10余篇;主持市科技局、省卫生厅青年基金、省自然科学面上项目各1项,参与国自然项目1项,以副主编身份参与编写专著1本。研究方向:睡眠呼吸紊乱性疾病、呼吸介入诊疗的临床和基础。

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