推荐非肿瘤疾病标志物数据库

前段时间,有果友问我,芒果老师有没有血液病专门的数据库?也有果友是研究糖尿病或者肾移植的,也私下问题有没有可以参考的数据库。


确实,平时使用的TIMER、GEPIA和TISIDB等数据库,主要针对实体瘤,对于血液病提供的信息不多,生信分析非常局限。那么有没有专门做血液病或非肿瘤疾病的数据库呢?答案是有!

Human Serum Autoantigen Biomarker Resource

推荐非肿瘤疾病标志物数据库

AAgMarkers是一个利用蛋白组芯片来寻找不同疾病之间血清学标志物的数据库。

网址:

http://bioinfo.wilmer.jhu.edu/AAgMarker/index.jsp


AAgMarkers目前支持12种疾病,分别是: 急性髓性白血病(AML)、阿尔茨海默病、基底样乳腺癌、Behcet's Disease 、早期帕金森病、肾移植、脑膜瘤、骨髓增生异常综合征、帕金森病、原发性胆汁性肝硬化、1型糖尿病和2型糖尿病。其中即含有血液病,也含有非肿瘤疾病如阿尔茨海默病、帕金森病、1型糖尿病和2型糖尿病等常见病。


推荐非肿瘤疾病标志物数据库

在输入界面,输入基因名称(如p53),并选择要分析的疾病或者全部分析,然后点击submit即可。注意,不是所有的基因在这12种疾病中都有分析结果!

推荐非肿瘤疾病标志物数据库

点击蛋白名称位置,比如进入TP53TG5。

蛋白信息

推荐非肿瘤疾病标志物数据库

数据库信息

推荐非肿瘤疾病标志物数据库

标志物价值,TP53TG5在阿兹海默症中具有生物标志物价值,正常和患者之间的表达具有显著性差异(p=8.5E-5),也具有统计学价值(AUC=0.787)。这些是可以放在文章里面用的哦。

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