荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

英文论文查重,免费,客服微信号sywsw1或sywsw2

Image J是一款功能强大的图像处理软件,在生物数据分析中应用极为广泛,重点是该软件是免费开源的!Fiji是包含了很多不同功能插件的Image J,即加强版的Jmage J,因此为了使用方便,建议大家直接下载Fiji。

           荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?-医学科研网
           

在我们利用荧光显微镜获得一张图像后,该如何更漂亮的、更专业的给老板和同实验室的小伙伴展示呢,今天我想跟大家分享一套常规操作~~

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?
1
第一步 调节图像亮度和对比度

在用显微镜拍摄图像的时候,有时候因为仪器激光强度和曝光时间等参数设置的不太合适,或者信号本身表达量比较低导致获得的荧光图像偏弱、比较暗,看不清信号;亦或有一些背景信号,这也会影响图像的展示,因此为了方便和清楚的观察信号,适当的调节图像的亮度是必要的。

1.打开图像之后,选择Image-Adjust-Color balance


荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

                       

2. 即可调出如下调整框,拉动滑条进行亮度的调节,第一个滑条Minimum向右拉是扣除背景;第二个滑条向左拉是调亮;第三个滑条大家自己试一试就知道是干啥的啦;在Channel 1下拉框选择需要调节的通道。所有通道调节完毕后,如果点击Apply则会将调节之后的灰度值应用到图像上,进而更改图像,在这里小编不建议大家点击Apply

           
           

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?
2
第二步 添加标尺

如果打开的图像是显微镜原始格式的文件,例如尼康的nd2、蔡司的czi\lsm\zvi、奥林巴斯的oir\oib\oif、徕卡lif等显微镜原始格式文件,则直接调出标尺即可。

1.选择Analyze-Tools-Scale bar

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

           
           

2.显示如下Scale Bar界面,进行参数设置,其中Width in um 和Height in pixels 设置标尺条的长度和高度;Font size 设置字体的大小;Color设置标尺和字的颜色;Background设置是否有背景色或选择何种背景色;Location 下拉键中选择把标尺放到图片中哪个位置,如右图,可以选择四个位置;Overlay 勾选表示标尺会嵌在图片中,不能再修改。

   

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

       
           
                        

3.其实也可以自由设定标尺放置的位置,打开图像后先点击矩形选择工具(菜单栏File按钮下方的灰色矩形框)在图像上画出一个想放标尺的框,然后按照上述操作进行就好了

           
         

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?
3
第三步 保存图像

同时保存单通道和merge图像,最后将这些图像排版成一张图像进行展示,利用montage功能进行多图排版。

1. 保存单通道图像. 打开一张包含多个通道的图像后,选择Image-Color-Split Channels… 即可将一张多通道图拆分成多张单通道图,然后分别选中这几张图点击File-Save as-Tiff即可保存并用于展示。

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

2. 保存多个通道merge图像. 首先按照上述方法进行通道拆分,拆分成单通道单张图像后,同时打开这几张图,选择Image-Color-Merge Channels… 进行通道merge     

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

           

3. 最后我们大多数时候会选择在ppt中同时显示这一组单通道和merge图片,那么在这里我们可以利用montage功能完成

A.首先在软件中同时打开保存好的单通道和merge图像,如下图

         

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

 
           

B.然后选择 Image-Stacks-Image to stacks 制作成一个stack图

           

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

           

C.即可生成一个如下包含三张图片的图,

           

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

           

D.然后选择Image-Stacks-Make Montage… 排版

           

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

           

E.即可显示如下界面并进行设置,Columns 和 Rows表示这三张图像以几列几行的方式排版;Scale factor表示新生成的图片在原始图像的基础上放大缩小的比例;First slice和Last slice表示stack图像中的哪几张需要排版展示;Increment表示选择的连续图像是否间隔展示;Border width 表示排版出来的相邻图片之间留白的长度,单位是pixel;Lable slices勾选上会给图像进行编号,Font size表示编号号码的字体大小;全部设置好之后点击ok

           

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

           

F.即可生成一张如下所示图像,注意,是一张哦!保存后直接在ppt展示就好啦      

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

 


         

延伸阅读:

写英文论文如何避免抄袭?(内附福利)

大家小心所谓的大龄科博住培医

如何准确使用英语时态?

如何用image pro plus和image分析免疫荧光图片?

SCI制图中快速对齐图片的三个小技巧

荧光显微镜图像,该如何更漂亮地展示呢?

生物医学科研方法

151个单位获批为国家自然科学基金依托单位

2020-12-10 7:46:01

生物医学科研方法

期刊PeerJ引诱投稿人在中国地图上删去台湾及南海,投稿人:你不配!

2020-12-10 8:15:12